在核酸冷冻离心干燥仪内进行的干燥近似于工业干燥器内的干燥过程，采用流化床工艺。一台鼓风机将外部空气穿过一个过滤器吸入，气流经过发动机、电热丝之后，穿过带孔的涌流底板被吹入干燥容器(可以取下)内。固体颗粒在干燥空间内被扬起，彼此之间保持分离，这也就避免了在其他一些干燥工艺中出现的表面粘合现象。
在质量控制、样品制备或研发部门都得以广泛应用。对于化工、制药、有机、无机领域的疏松材料可进行无损干燥，而没有点状局部过热现象。样品特征涵盖粗、细、晶体状、纤维状或片状。空气流经强劲的鼓风机吹出，短时间内将待干燥样品吹松并均匀混和。流动层在间歇式操作下能得到更好的混合。其操作温度、干燥时间和空气量可进行电子设定并不断调整。
随着国家提倡节能环保以及相关措施的推进，核酸冷冻离心干燥仪如何实现节能、环保的要求成为干燥设备制造公司不得不思考的问题。有厂家在对其性能进行充分研究的基础上，总结出了一些有效的节能降耗措施，笔者对此进行简要的整理。
1、提高热风的进塔温度。据了解，在离塔温度不变的情况下，热风的进塔温度越高，传递给泥浆雾滴的热量越多，单位热风蒸发的水分越多。在生产能力恒定的情况下，所需热风量减少，如此便可以减少热量损失，降低核酸冷冻离心干燥仪的热量消耗。
2、可以适当降低热风的离塔温度。在热风的进塔温度恒定不变的情况下，降低热风的离塔温度，可以减少热风离塔时所带走的热量，较大限度地利用热风的热量来干燥物料。
3、增大进塔热风与离塔热风之间的温度差，通过提高热风的进塔温度或降低热风的离塔温度，增大进塔热风与离塔热风之间的温度差，充分利用热风的热量蒸发物料的水分，从而达到提高喷雾干燥塔的热效率、降低能耗的目的。
4、可以通过降低物料的含水率，来提升干燥仪的生产效率。事实上，流动性好、易于雾化的物料，可有效缩短喷雾干燥时间，在物料中添加适宜的减水剂，可降低含水率，加速干燥时间。
5、可以通过热交换器来回收利用废气余热，从而达到节省能源的目的。例如，在使用期间，利用热交换器将能够更为充分的利用热量，从而提高核酸冷冻离心干燥仪的雾化效率，减少能耗。
